Puskesmas Pantai Amal terletak di Sei Kayan RT.03 Pantai Amal Lama, kecamatan Tarakan Timur, kota Tarakan Kalimantan Utara. Wilayah puskesmas meliputi 15 rukun tetangga, dimana merupakan daerah pantai dan wilayah budidaya rumput laut. Jarak tempuh dari puskesmas ke desa terjauh sekitar 10 km.
Puskesmas Pantai Amal adalah fasilitas kesehatan tingkat pertama (FKTP) yang menyelenggarakan upaya kesehatan masyarakat (UKM) dan upaya kesehatan perorangan (UKP) dengan lebih mengutamakan upaya promotif dan preventif di wilayah kerjanya, untuk mewujudkan masyarakat sehat mandiri di wilayah Puskesmas Pantai Amal. Puskesmas Pantai Amal merupakan puskesmas rawat jalan, memiliki 7 posyandu, 1 posyandu lansia dan 2 unit ambulans.